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除了基于CTC-mRNA的分析，在CTC的保存完好的mRNA使致癌基因重排，其代表的未满足的临床需要，并通过电流的mRNA CTC分析仍然未开发的检测和定量。的间变性淋巴瘤激酶（ALK）和ROS1重排定义的患者的非小细胞肺癌（NSCLC）谁是高度响应ALK / ROS1酪氨酸激酶抑制剂（TKI），例如，克里唑替尼（10，11）的亚组的存在。肿瘤学家越来越接受非侵入性诊断解决方案，使这两个初始检测和非小细胞肺癌进展的连续监测器（12）。鉴于其（i）mRNA的具有相对有限的寿命和（ii）有重排的转录物（13-15），检测和在患有非小细胞肺癌的血液ALK / ROS1重排精确定量的多种形式已被证明具有挑战性的，进一步强调需要优化的CTC平台，迅速恢复高品质的完整基因的基因重排分析的能力。此外，各种下游的mRNA测定法之一，逆转录液滴数字聚合酶链反应（PCR）（RT-ddPCR）（16）是理想的的CTC检测基因重排。在一个独特的水油乳化技术的基础上，RT-ddPCR提供了量化少量CTC mRNA的单分子精度的简化的工作流程。此外，RT-ddPCR可以通过PCR引物和记者设计识别潜在的基因重排的合作伙伴。

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